Strukturen af drivhusventilationssystemer varierer afhængigt af drivhustype og designmål. De kan hovedsageligt opdeles i to kategorier: naturlig ventilation og mekanisk ventilation. Kernestrukturen omfatter ventilationsåbninger, drivenheder og styresystemer.
Tagvinduesventilationssystem: Ovenlys, der kan åbnes, er installeret på højderyggen eller det øverste område af drivhuset, typisk drevet af en tandstangsmekanisme eller en elektrisk aktuator, hvilket giver mulighed for automatisk eller manuel åbning og lukning.
Sidevinduesventilationssystem: Ventilationsvinduer, der kan åbnes, er installeret på drivhusets sidevægge. Almindelige typer omfatter roll-up (filmdrivhuse) og roterende/bevægelige (glasdrivhuse).
Rulle-op-type: Dækfilmen rulles op fra bund til top ved hjælp af en manuel eller elektrisk oprulningsmaskine, så der opnås stor-ventilation. Om sommeren kan det rulles helt sammen, hvilket gør drivhuset næsten som et åbent-grundmiljø.
Roterende/bevægelig type: Bruger metal- eller plastikvinduer, åbnet af en motor eller manuel håndsving, velegnet til glasdrivhuse, der kræver høj lufttæthed.
Mekanisk ventilationssystem: Aksialstrømsudsugningsventilatorer eller centrifugalventilatorer er installeret på drivhusets side- eller endevægge, der arbejder sammen med luftindtag (normalt sidevinduer eller dedikerede luftindtag) for at skabe tvungen luftstrøm.
